Jornalista e cofundador da Mediapart. 

Jornalista no semanário VSD, depois no jornal Libération (1986-1994), onde foi vice-diretor de redação da seção Política. Mais tarde, foi jornalista no Le Monde (1995-2006), onde foi vice-diretor da seção da Sociedade, correspondente em Moscou e editor-chefe da seção Internacional, sucessivamente. Em 2007, foi vice-editor do editorial no jornal Marianne.

Bonnet é um dos fundadores da Mediapart em 2008, onde foi diretor editorial por 10 anos até 2018, quando se tornou administrador da Mediapart Publishing Society.